处理客户退货发票的方法如下：
收回原发票并作废
如果能够收回原发票，应当收回原开出的销售发票，并在发票上注明“作废”字样，然后开具红字发票进行冲销。这一步骤是为了确保账目的一致性，并避免重复征税。
无法收回原发票的处理
当原发票无法收回时，商家需要提供一系列证明文件，包括购买方无法退回原发票的原因说明、退货原因及明细说明文件、原购销合同或订单复印件、退货货物的运输单复印件等。然后，根据退货金额开具红字发票交给客户。
账务处理
在处理退货发票时，需要进行相应的会计分录调整。具体分录方法如下：
尚未确认销售收入的售出商品发生销售退回：
借：库存商品
贷：发出商品
如果发出商品时已经发生了纳税义务，需要在退回时考虑：
借：应交税费--应交增值税（销项税额）
贷：银行存款等。
已确认销售商品收入的售出商品发生销售退回：
借：主营业务收入
应交税费--应交增值税（销项税额）
贷：银行存款等
同时：
借：库存商品
贷：主营业务成本。
税务申报调整
根据相关税务法规，商家需要在客户退货后立即作出相应的调整，并在纳税申报表上进行正确的申报。这可能包括调整已申报的增值税、进项税额转出等。
客户通知
商家需要及时通知客户退货金额已经调整，并告知客户相应的退款金额，以确保客户了解整个退货流程和结果。
记录和存档
商家需要详细记录退货信息，包括退货原因、退货数量、单价、金额等，并确保这些记录与退货发票、收款单等相关文件一起存档，以备后续审计和查询。
通过以上步骤，商家可以确保退货发票得到正确处理，同时遵守相关税务法规，维护企业的财务合规性。